什麼是字母啟示?這種新的Google DeepMind工具分析了基因突變

Google的人工智能(AI)公司之一DeepMind的研究人員提出了一種新工具,可以預測遺傳突變是否具有潛在的致病性,這一突破可以幫助研究罕見疾病。

該工具著重於所謂的錯義突變,其中有一個核苷酸變化,這意味著DNA代碼的一個字母受到影響。

如果將DNA與字母表進行比較,則錯義突變就像錯別字,並且可以改變所得的氨基酸。

一個人有大約9,000個這些突變,其中大多數是良性的。但是,其中一些突變是導致囊性纖維化,鐮狀細胞貧血或癌症等疾病。

目前,在人類中已經觀察到了這些突變中的四個,但只有2%被歸類為致病性或良性。

總共有7100萬種可能的突變。該公司表示,它們通過Alphamissense工具對它們進行了檢查,該工具能夠將其中89%分類。

字母啟示如何工作?

每個突變的得分在0到1之間,表明其具有致病性的風險,即引起疾病。 Alphamissense預測57%的可能是良性的,而32%的可能是致病性的,其餘的不確定。

該數據庫已公開,並通過Girub,一個存儲和共享計算機代碼的平台。關於調查結果的研究於週二發表在《雜誌》上科學

專家約瑟夫·馬什(Joseph Marsh)和莎拉·泰希曼(Sarah Teichmann)在科學上也發表的一篇文章中寫道:“作者表現出了alphamissense的出色表現。”

該工具已在人類和靈長類動物DNA的數據庫上進行了訓練,從而使其能夠識別出哪些遺傳突變是普遍的。

Google DeepMind的科學家Jun Cheng解釋說,該工具可以告訴蛋白質序列是否令人擔憂。

他補充說,這些預測可能會增加罕見疾病的診斷率,並有助於找到涉及疾病的新基因。

研究人員聲稱,這可能會導致新療法的發展,但是,警告說,不應自行使用字母釋放來進行診斷。

alphamissense是基於Alphafold,由Google DeepMind在2018年提出的另一個機器學習計劃,該計劃發布了最大的蛋白質數據庫,擁有超過2億個結構。